整烧杀掠夺了一夜。县中百姓一夜死者上千，尸横於道，血流满城，到处是悲痛大哭的妇孺，街上来往尽为提刀荷锄、负钱挟美的兵卒。闳、冯等大姓在城中的族人、子弟被杀了一个精光，有的房屋被点火烧着，黑烟滚滚，遮掩了半个县城。
略作休整后，波才、何曼分兵两路。
何曼带着上万本部精壮，东出父城，会合了驻扎在巾车乡的数千黄巾军兵卒，挟大胜之威，围攻昆阳，欲再接再厉，把昆阳也打下来。
波才则带着其余六七万的人马留在父城，一边分兵攻打父城周边乡里豪强大族的坞堡庄子，搜略粮食财货，一边全力进行整编。
上次整编，一因急於南下，二因部众多不情愿，故此草草收场，只有波才、何曼两人的嫡系完成了整编。这一次波才下了决心，加上有何曼的全力支持，部众中虽仍有不情愿的，却也难以再构成什么阻力了。
十几个县的道众同时进行整编，波才亲去各县营中督查，有阳奉阴违或迟缓太慢的，或鞭笞、或训斥，雷厉风行，只用了两天，就初步完成了改编，得精壮能战者三万余人，加上何曼带走的上万战卒，共得战卒近五万人，其中精卒五千，骑近千。
五千精卒中有千人是波才原本的嫡系甲士，其余的