司令部改组更深层次的原因是日本军界中两种势力的斗争结果。
在日本军界存在着两种势力，一派主张继续搞政变，由天皇依靠军队直接进行统治，称为“皇道派”。
皇道派拥戴前陆军大臣荒木贞夫和教育总监真崎甚三郎，其成员多为下层军官，与民间激进法西斯组织联成一气。
另一派主张利用军部现有地位，联合官僚、财阀，掌握内阁实权，建立“高度国防国家”，以加速对外侵略，为此就必须“统制”（约束）军队的能力，因此被称为“统制派”。
这一派则是拥戴现任陆军大臣林铣十郎，其成员永田铁山、东条英机，多为中坚军官。
尽管皇道派和统制派都秉承日本对外扩张的理念，说白了这两派都是日本法西斯化过程中的产物，都是对外扩张的鼓吹者。
但是由于方法不一样，所以两派之间的关系也非常紧张，相互看对方不顺眼。
相比于统制派的温和，皇道派则是一个松散的集团，大体上由年青的野战部队军官，甚至是中队级军官组成的。他们的行动非常大胆、不听指挥，经常毫无组织纪律的活动，包括暗杀和搞政变。
军队内部的斗争是相当残酷的，嘴上如果达不成协议的话，流血是必然的