远保守派，开始重用大久保利通，“精忠组”也获得了合法地位。
尽管萨摩藩和幕府都在策划让幕府和朝廷合作以对付外来危机的“公武合体”运动，1862年同大久保利通一起率藩兵一千人进京，向朝廷施加压力。这样的军事行动在德川幕府时代尚属首次。
就在大久保利通积极推进公武合体运动之时，早年的“精忠组”同志有马新七等人因早已投入更加激进的尊王攘夷运动，正在策划乘岛津久光进京之际袭击佐幕派公卿。大久保利通为达到自己的目的，在派人劝说无效后，断然派兵杀死有马新七等人，是为“寺田屋事件”。此事件造成公武合体派和尊王攘夷派的完全分裂，并加速了公武合体运动的进程。朝廷颁布敕命。基本满足了岛津久光的要求并宣布要改革幕政。1864年初，作为公武合体运动结晶的雄藩会议筹备就绪，设置了德川庆喜、岛津久光等六人组成的“参与会议”，在天皇主持下讨论国策。然而，因各雄藩各怀私心，政见不同，德川庆喜则梦想幕府重新独揽大权，不到三个月，“参与会议”便因六参议的相继辞职而烟消云散。公武合体运动遭受重大挫折。
而尊王攘夷运动在一度沉寂之后。重新高涨起来。1865年初，另一雄藩长州的藩政权回到尊王