三部之中，共计设盟九个、旗六十三个。其中喇嘛旗十二个，另外加封那位流落在青塘吐蕃诸部，原吐蕃赞普直系后人，俸禄等级在奉恩与不奉恩国公之间的奉恩公一名，奉恩将军两名。并为单独设立一旗，准许其在日月山与青海湖之间耕种，自招旗民不得超过两千帐。
诸旗噶伦大部分为国公，少部分为将军。噶伦下面设立噶伦同知、左右佐领，台吉等官员，分别负责旗内的民政、军务。诸旗详细游牧区域，则因为还需要枢密院与兵部，派出重臣去青海另行划分。眼下新春将至，黄琼打算此事待来年春暖花开之后，由郑道远负责牵头此事。
同时，朝廷设置在西京的国子监，为青塘吐蕃诸部每年提供六十个名额。这些世家子，每年读书的费用，一律由朝廷负担。并且朝廷准许青塘吐蕃世家子弟，通过读书科举出来做官。即便没有通过会试，但取得举人身份的，一样可以按照汉地同样标准，准许参与举人选官。
至于吐蕃腹地那些大大小小的王国，则册封了郡王五，国公十一名。但所有的郡王与国公，一律不加奉恩二字。其俸禄，按照青塘吐蕃诸部递减。反正那些郡王与国公，本身就是大奴隶主、大贵族，供奉寺庙时银钱都肯大把的花出去，想必谁也不稀罕朝廷的那点俸禄