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在殖民卫星门德尔的研究所内部，穆和阿斯兰两人因克鲁泽说出的冲击性的事实而受到极大的震撼：
到现在阿斯兰才知道，原来基拉是双胞胎中唯一被进行遗传基因操作而在人工**里成功出生的最强调整人，而克鲁泽竟然是穆的父亲——阿尔塔·弗拉格的克隆体；克鲁泽的最终目的，则是终结这个充斥着欲望的世界。
穆和阿斯兰留在了研究所里；克鲁泽则返回了威萨利乌斯号上。
等到乌鸦高达和禁断高达恢复过来后，主天使号再度对大天使号发动了攻击；而强袭、暴风和正义三架高达均未返回的大天使号，只得由自由高达和GN堕天使前往应战。
另一方面，返回到威萨利乌斯号上的克鲁泽，将“打开门的钥匙”托付给了芙蕾之后，开始向大天使号发动攻击。
战斗中，芙蕾带着“打开门的钥匙”乘上救生舱离开了威萨利乌斯号，并发出了救命信号。听到芙蕾的声音后，基拉迅即赶往救生舱，但却为林枫所阻拦，而我因为被禁断，主天使号和那三艘的舰船与MS不要命的炮火死死拖住所以没能立刻赶过去。
救生舱被主天使号回收成功。终于得到了“打开门的钥匙”里关于“