经将天空基地停止的程序再度恢复了运行，天空基地的危机终于解除了。不过这一次却给众人提了一个醒，那就是控制程序全都集中在司令室一旦这里被控制了，就等于控制了整个天空基地。以往都认为敌人不可能突破司令室重重的防御，可是这次却重重的打了他们一巴掌。
为此技术部门已经开始重新规划线路，准备设置可以切断司令室控制的程序，以免有一天会再度发生这样的事情。而这次入侵的敌人是谁也就成为了无头公案，而因为外面战斗中产生了大量的能量，严重干扰了卫星图像，让众人只能看到两个黑影无从分辨战斗双方是谁，虽然每个人心中都猜测可能还是奥特曼的战斗，不过谁都没有说出来罢了。
蓝色的流光坠落到一个大厦的顶层，藤宫无力的躺在了楼顶之上大口的呼吸着。
“我梦，你变强了啊。”藤宫喃喃自语道：“不过我一定要打倒你们，只有这样才能拯救地球。”
在地球外的宇宙虚空中，吸收了盖亚和阿古茹战斗所发出能量的那处虚空周围慢慢的出现了如同水波一样的波纹，并且在逐渐的扩大，虽然相对于宇宙而言是相当缓慢的。
连续发生的防卫军设施被入侵的事件，让防卫军上下都高度的重视，为此责令搜查科的赖