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立法院立法后，交给大理寺入案，司法院审查完后，同样也将案子交由大理寺，大理寺拿着立法院的律法，根据司法院提供的资料，对犯人经行判决。
说的通俗一点，这就是一个三角恋。
大理寺相当于最高法院，虽然它不归任何部门管，但是它又受到司法院和立法院的牵制，并没有拥有什么太大的权力，只是一个机构而已，真正的权力还是掌握在二院手中。
开封府从此之后。再也不会出现下一个包拯了，因为开封府失去了审查权和审判权，他的存在就是负责开封府的政务。但是这不影响开封府尹升为宰相的途径，宋朝很多宰相都是将开封府尹直接提拔上去的。秦桧也是如此。
而御史台作为一个监察机构，也因为二院的出现，它的权力也发生了微妙的变化，它没有判决权，但是它还是保留了审查权，它既可以将案子交给司法院，也拥有直接上诉大理寺的权力，一般一些重大的内政案。他甚至可以直接跳过司法院，直接向大理寺上诉。
当然，一些个别案例，御史台还可以跳过大理寺，直接上诉皇上，这也是皇权凌驾于律法之上的又一大佐证。
但是比起以往来，还是有不小的区别，以前皇上可以直接审案，直接