一个千户所，则是需要正千户一人，正五品；副千户二人，从五品；镇抚二人，从六品；百户十人，正六品。再往下，更是总旗小旗无数。
一个卫一个千户所就能带来这么多官位，那么四百余个卫所能带来多少？
算算就让人害怕！
这么大一个机构，牵扯这许多的利益，能是说设就设的？
这是第一桩难处。
而第二桩难处，则是更大了一些，盖因现在如果要设立奴儿干都司的话，那么不是凭空设立的，而是要顶掉一个机构。
被它顶掉的衙门，叫做奴儿干总督衙署。
奴儿干都司本是统领整个东北军民各部的一个机构，而朵颜三卫和三姓女真先后自立之后，这个机构便是不那么合时宜了，控制力度有限。是以朝廷废止奴儿干都司，设立奴儿干总督区，设奴儿干总督，加左副都御使衔儿，提督奴儿干诸军事，兼理粮饷等，一般是文官来充任。
而在奴儿干总督之下，又是有四大将军辖地，分别是镇守松花江南岸区域的松花江将军，镇守阿速江一直到鲸海大片区域的阿速江将军，镇守鸭绿江以北，原本建州女真部故地，临近朝鲜的建州将军，镇守辽东以北，和朵颜三卫接壤地区的辽北将军。