指挥直接管辖五旗。
张乐行自领黄旗，兼黄旗总目。
苏天福、龚得树、韩老万、侯士伟分别担任黑、白、蓝、红各旗的总目。
五旗之外，另有西北白彦虎领导的西北各族起义联军
总旗之下有“大旗”，是组成捻军的基本单位。
大旗设大旗头，称“趟主”。
大旗之下还有“小旗”，是最基层的组织。
这种五旗军制的组织形式。把处于分散状态的捻军初步统一起来。
张乐行为盟主，但是这个盟主不仅仅是各方势力的盟主，而是天军任命的盟主，意思是按天军的要求，管理这些捻军会中，实现天军的任务。
同时宣布信条，制定行军条例，这些都是天军现有的相关规定。
起义口号：救我残黎，除奸诛暴，建立天国。
其中军规条例。都是针对当时的满清军队以及土匪武装的所作所为。做出旗帜鲜明的禁止，其中包括严厉的十三斩。
兵到之处，玷污妇女立斩。
强污幼童立斩。
掳掠妇女幼童隐藏不献者立斩。
不遵号令约束者斩。
小卒无理持械敢拒首领者斩。
临阵时故意