皇帝之后的陈友谅第一件事就是报复陈友定，再次命邓克明率军攻打福建，但是这一次依然遭到惨败，打的邓克明一路溃退到了江西境内，才堪堪稳住阵势，自此陈友谅也就不再轻易攻打福建了，他知道这个和他名字一字之差的家伙确实不好惹，加上北面和东面还有朱元璋、张士诚等威胁，所以陈友谅收回了南攻重心。
后来，陈友谅亲率大军及家眷共60万进攻南昌，最终在鄱阳湖遭遇惨败，一场大战下来陈友谅中箭身亡，太子也被朱元璋俘虏，虽然陈友谅还有子嗣，但是再也难以挽回颓势了，陈理率众投降朱元璋，随后被朱元璋迁往高丽定居。陈友谅一系灭亡之后，想要一统天下的朱元璋，自然也将目标盯向了福建，在朱元璋与陈友定发生激烈战斗，期间双方互有胜负，在朱元璋俘获陈友定部将不久，陈友定也俘获了朱元璋爱将胡深，并且还将其斩杀，本来朱元璋是想不惜财物将胡深换回的，可没想到陈友定却斩杀了胡深，对此朱元璋自然殊堪痛恨。
朱元璋再次派出大军南攻陈友定，此次明军水陆并进围困了福州城，走投无路的陈友定在妻妾女儿后想要服药自杀，但是后来却被救下，其在朱元璋召见他的时候，仍然不改忠心元朝态度，大怒之中的朱元璋将他与他儿子陈海一起处死。