孙綝上表入谏求情，但孙亮不予准许，派遣左将军丁奉诛杀了朱熊与朱损。
此时，孙亮与孙綝的矛盾已经公开化了，因此孙亮则私下与其大姐全公主孙鲁班、太常全尚、将军刘承等，讨论诛杀孙綝事宜，但谋事不密，被孙亮的一个妃子知晓，那个妃子是孙綝从外甥女，于是偷偷向孙綝密报此事。孙綝连夜带兵缉拿了全尚，并派遣其弟孙恩在苍龙门外杀害了刘承，然后举兵包围皇宫，命令光禄勋盂宗到宗庙祭祀先帝，召集群臣宣布废掉孙亮，群臣十分震惊，无人敢违抗孙綝的命令。孙綝乃派遣中书郎李祟去夺取了玉玺，以诏书的形式向全国公布孙亮所谓的罪状，尚书桓彝不肯在诏书上署名，被孙綝杀害，典军施正劝孙綝立孙权六子琅邪王孙休为皇帝，孙綝表示同意，于是命令宗正写信给孙休，随后将孙休迎回建业登基称帝，另将废帝孙亮贬为会稽王，送回封国;将全公主迁徙至豫章郡，全尚则被流放至零陵郡。
孙休即位后，孙綝上疏给孙休，来表示自己的忠心，孙休则下诏封孙綝为丞相大将军兼领荆州牧。孙綝之弟孙恩被封为御史大夫、卫将军，孙据为右将军，二人皆封县侯。孙干为杂号将军、亭侯，孙闿也受封为亭侯，孙綝一门五侯，而且皆掌管禁军部队，权力远远超过皇帝，是东吴的