万斛，曹操非常激动，下令表彰杜畿：“河东太守杜畿，孔子所谓‘禹，吾无间然矣’。增秩中二千石。”
曹操征汉中张鲁时，从河东调发五千名民夫运粮，民夫在路上自相劝勉：“人生有一死，不可负我府君！”在千里运粮，艰苦转战中，五千名民夫没有一人逃亡。后来，曹操表彰道：“昔萧何定关中，寇恂平河内，卿有其功，间将授卿以纳言之职，顾念河东吾股肱郡，充实之所，足以制天下，故且烦卿卧镇之。”杜畿升官到朝廷，赵俨继任河东太守，送的寡妇一下子就多了起来，魏文帝曹丕责问杜畿：“以前你送得那么少，我还以为河东没有寡妇，现在为什么又多了起来？”杜畿正颜厉色回答道：“我以前征集的寡妇，都是死人妻，现在赵俨征集的，都是活人妻！”曹丕和周围的人一听，脸色都变了。
曹丕称帝后，杜畿进封为丰乐亭侯，邑百户，任司隶校尉，后来又升为尚书仆射，曹丕出征时，杜畿常留守京师，算是曹魏的重臣了。曹丕命令杜畿监造御楼船，造成之后，杜畿亲自到陶河试船，不幸遇到风暴，溺水而亡，时年六十二岁，曹丕非常悲伤，在诏书中写道：“昔冥勤其官而水死，稷勤百谷而山死……”称赞杜畿和古代的名臣冥、稷一样光荣殉职。追赠为太仆，谥为戴侯。