年,尤其是明帝在位的十余年间,处理日常政务、出师用兵等大小事,都由他们二人亲管。朝廷决议大事,也经常让他俩决断是非,择定而行。中书省的权力极大,官员们一听“中书”之名,都奉行不敢违背,于是中护军蒋济上书,认为他们权力太重,且每日侍奉皇帝左右,应该加以提防,避免出现“恶吏专权”之弊端,明帝不听。征东将军满宠、凉州刺史徐邈领兵在外又位高权重,经常受到诋毁,而孙资据理力争,说明他们平常的作为,使其不受猜疑。满宠、徐邈可保持功名,有赖孙资帮助。田豫等人曾经毁谤孙资,孙资却不以为意,之后田豫等人感到惭愧,要求和解,孙资同意,并且令长子孙宏娶田豫之女,并照顾年老在家的田豫。
明帝卧病在床,打算安排后事,想以燕王曹宇、领军将军夏侯献、曹爽、顿骑校尉曹肇等宗室大臣辅政。夏侯献、曹肇对孙、刘二人长期专权早心怀愤恨,曾指着大殿前的一棵鸡栖树借题发挥说,“这也太久了,看他们还能活几天!”孙、刘闻知,非常惧怕,决心阻止他们掌权。一日魏明帝准备让曹宇以大将军名义辅政,曹宇照例谦辞推让,明帝问进入卧室的孙资和刘放:“燕王应该如此吗?”孙、刘二人回答:“燕王知道自己能力不行,所以才推让。”明帝问:“谁可