为曹操是一代雄杰，任峻率领其宗族、宾客及部曲数百人归附曹操，曹操大悦，上表朝廷，拜任峻为骑都尉，又把自己的堂妹嫁给任峻，把他当成亲信加以任用，每当出征讨伐，都让任峻留守后方，供给军需。
北方久经战乱，土地荒芜，哀鸿遍野，民不聊生，农业与经济遭到惨重的破坏，史载：“谷一斛五十余万钱，人相食。”加之灾荒连年，军需严重不足，直接威胁着曹操的统一大业。谋士枣祗等向曹操提出建议，施行屯田，得到了曹操的赞许，立即授命任峻为典农中郎将，具体统管屯田事务。任峻大量招募流民，在许施行屯田，又命令各郡国置屯田官，负责当地的屯田，几年光景，大见成效，基本上消除了饥荒，“仓廪皆满”，使北方的农业经济得到一定恢复。
袁曹官渡决战，曹操派任峻掌管兵器和粮食运输，在运粮过程中，曾多次遭到袁绍军队的攻杀抢掠。于是，任峻以兵马布阵设防，阻挡了敌军的寇扰，保障了前方军队的供给，使曹操能够顺利地战胜袁绍，赢得官渡之战的全胜。为了表彰任峻的功绩，曹操再次奏请朝廷封任峻为都亭侯，食邑三百户，并且官迁长水校尉，秩比二千石，掌管宿卫军队。
任峻为人宽怀大度，明白事理，曹操乐于采纳他的建议，很器重