紧去投马士英军中，献诱降捕杀同乡刘超之计, 事成之后，马士英保举，丁魁楚起复为总督河南湖广加兵部尚书。
弘光南京称帝后，马士英有拥立之功，贵不可及，丁魁楚因结交马士英，因此便被任命仍总督河南、湖广，兼巡抚承天、德安、襄阳，还未上任，逢两广总督沈犹龙入朝为侍郎，便改任两广总督，不久又加兵部尚书衔，此后又兼广东巡抚。
朱以海之前也特意问过马士英，马士英也很坦白，说他跟丁魁楚关系很好，当初也正是因为私下关系好，当河南局势糜烂时，丁魁楚提出想转督两广, 他也是立马答应。
他召沈犹龙入朝, 以丁魁楚代之，两人一个在朝，一个在外，相互支持。
朱以海监国，得到丁魁楚拥立，很是感激。
此后他南京即位，也还特给丁魁楚加了协理戎政衔，又以平定桂江王叛乱之功，特旨封伯爵。
不过朱以海对于丁魁楚越来越不满，主要还是因为此人带甲五岭，并不太配合朝廷的新政，不论是罢废卫所，还是摊丁入亩，又或是官绅一体纳粮，还是说火耗归公，开征海关、厘金这些，这个家伙都很不配合。
朱以海屡调岭南兵，结果他都以无兵无饷推脱，税赋新政，却又迟迟不得推行