良久之后，郑芝龙拉着李长祥入座。
三十多岁的李长祥是崇祯十六年进士，是首辅薛国观的同乡，薛国观曾欲引为私人，为其所拒，他是四川人，性格直爽，甚至曾经直言进奏，称要选派大臣督师，无他计，唯有请便宜行事，虽金牌亦不受进止。
北京亡，南下，与张煌言为好友，一起四下奔走谋恢复。
朱以海在张煌言的推荐下，先授李长祥为浙江巡盐御史，此次则是巡按福建，他的好友张煌言这次则被皇帝授封为台湾巡抚。
台湾之前设府，这次虽并未设省，但却跟偏沅、郧阳、南赣一样，以形势特别为理由，特设一巡抚节制，这个台湾巡抚，提督军务兼理粮饷，巡抚台湾、澎湖，另福建的漳州、泉州二府，广东的潮汕，皆划入台湾巡抚辖下。
郑芝龙北上入阁，郑鸿逵接任福建总督，而张煌言任台湾巡抚，张肯堂仍为福建巡抚。
李长祥为福建巡按，徐孚远为台湾巡按。
“下官南下前，陛下亲自召见，再三交待，说郑公乃东南一柱，在东南百战威名，如今中原大战，特请郑公再出山，负责总督御营，入阁参政。
大公子也已经领御营虎贲八千南下，将联合闽粤几省的将士，一起讨伐大员的荷兰