至于明清时期的内阁制也是由此演变而来。
严格说来，秦汉开始中国历史上才正式有统一政府。秦以前的中国，更像一种封建的统一，到了秦汉，中央方面才有一个更像样的统一政府，秦汉所辖的各地方，不再是封建性的诸侯列国并存，而是紧密隶属于中央的郡县制度的行政区分了，所以三公制可以直接从秦汉时代算起。
“陛下所言不错，但二者之间也是大不同的。”王应麟捋捋胡须道，他长期担任吏部尚书，对此了解的极为深刻，也更有发言权。
“首先两者的官制结构不同。三公九卿制度管辖繁杂，无论庶务、军事、监察尽为一体，皇室家政与国政混为一谈，家国不分；而三省六部制则是集决策、核议、庶务为一体，各部间的自有事务分工，彼此间相互制约。”
“其次三公九卿制下的丞相只有一个，协助皇帝处理全国政事，集决策、核议与行政之权于一身，诸事可一言而决；三省六部制下，三省的长官皆可称相，分理诸事，相互制约，以免集权于一人。再有三公九卿制的确立使权力集于中央朝廷，三省六部制的确立则使集权制度趋向于完善。”
“朕明白了。”赵昺点点头道，“秦汉之三公九卿制度，宰相可以独揽大权，谓之独相。而三省