合木也是承袭的父爵，在平定江南时被改编成水军，参加过一系列争夺江淮地区的水上战役，战后作为探马赤军留守淮安，镇守山东和河南地区。
作为朝廷的战略部队，他们没有参加远征日本及安南的对外战争，而是在当地娶妻生子，渐渐的将这里当做了家乡。在江南平定后，经过一系列的整编，回回水军吞并了周边的一些回回屯驻军及工匠千户，成立了回回水军万户，下辖六个正军千户、四个屯军千户和一个工匠千户所，还有附属于他们的由驱民和新附军组成的百户所。
军屯是按照军队组织系统进行管理的，有关军屯的一切事宜，都由枢密院决定，呈报皇帝批准。军屯的土地，主要是因战争破坏而荒废的空地，均由朝廷发给耕牛、农具和种子，或者给钞作兴建屯田之资。屯田的士兵，有的就地落户，或全户入屯；有的是单身入屯，定期轮换。每个屯田军人所耕种的土地，大体为每人三十亩，但是军屯的土地归仍朝廷所有，屯军还要按规定交纳粮食，作为地租和赋税。
随着战争的远离，一切安定下来后，马合木虽没有机会再展示他的军事才能，却体现出继承于祖先的商人本色，利用自己占据江淮地区交通便利，物产丰富及属下士兵有技术，擅于经营的优势，将生意做到了