，如果恰巧跟锦衣卫的关系又不太和谐，那么一顿廷杖下来肯定是非死即伤。（）因此朝廷上敢于跟锦衣卫做对的官员并不多见，因为谁都不知道自己什么时候就会落到锦衣卫手里吃一顿要命的廷杖。
而三厂则是分为了东西两厂和内行厂。明成祖朱棣于永乐十八年设立了东缉事厂，由亲信宦官担任掌印太监。而东厂的掌印太监也是宦官中仅次于司礼监掌印太监的二号人物，其官衔全称为“钦差总督东厂官校办事太监”。如果说锦衣卫的职能是秘密警察，那么直接听命于皇帝的东厂便可成为真正的特务机关和特权监察机构，其权力还在锦衣卫之上。最开始两个部门还是有明确的权力划分，东厂并没有审讯犯人的权力，抓到的人犯只能交给锦衣卫审理，但到了明末的时候，东厂也有了自己的监狱。
东厂最大的优势便在于与上级的沟通渠道更为通畅，锦衣卫还需要用奏章来汇报工作，而东厂的掌印太监可以直接向皇帝当面作口头汇报，这种便利的条件是锦衣卫根本无法与之相比的。朝廷的所有衙门，都有东厂的番子坐班进行监视，其无孔不入的程度尤在锦衣卫之上。历史上明朝有名的几个大太监王振、刘瑾、冯保和魏忠贤都曾经统领过东厂，让这个特务机构在数百年之后仍然是恶名昭彰，但非