朱常洛死了，但红丸案的影响现在才刚开始。
朝廷里关于此案的议论甚嚣尘上，朱常洛死后的第三、四天，短短两天时间，请求追查朱常洛死因的奏折多达数百件。
有的奏本甚至公开指出，给朱常洛用泻药的崔文升是郑贵妃的人，虽然没直说就是郑贵妃指使的，但意思已经很明显了。
而弹劾朱由检的折子却一本都没有，朱常洛已经死了，那太子、皇孙间的明争暗斗也就没意义了。
朱由检不来东阁，折子又像朱由检没来之前一样堆积如山，内阁的担子都压在方从哲身上。
万历皇帝宅在暖阁里不出来，朝廷里的大臣他一个也不见，红丸案该以什么结论收场，也要由方从哲决定。
方从哲想了三天，才上了一本折子，万历看后批准，发往各个衙门观看。
方从哲的这道折子的手抄本送到各部衙门后，顿时引起轩然大波，在奏折上，方从哲非但没像群臣那样请求万历彻查凶手。
反倒还夸奖李可灼，并请求朝廷赐其银币，以示奖励。
这份折子立刻让方从哲成了朝廷公敌，追查红丸案的呼声越来越高。
礼部的折子更是直接写出：“从哲纵无弑君之心，却有弑君之罪。欲辞