制。
从中长期来看，穿越者的作战骨干力量必然是以这个时空的原住民为主的新式军队，无论叫它“新军”、“土著军队”都好，其核心思想是一样的。穿越者在人力资源上的极端弱势，即使全部充任行政官员和技术人员都显得力不从心，更不要说去当兵打仗了。
以穿越者为主要力量的现有军队必须解散从新组建成新军。目前在军事组内长期服役的人员，已经超过了全体穿越者人数的10％以上。这些掌握了现代技术和思想的人在担任着大量的巡逻、警戒和小规模作战，这是对人力资源的严重浪费。
预计中新组建的军队――马千瞩提议叫“新军”，而不是什么“土著军队”，以示和未来等级更低的军队作为区别――士兵、士官都是明朝人。随着军队规模的扩大，未来的军官团也将以明朝人为主
新军的兵员将主要来自农民和旧军队，尤其是卫所制度下的一般军户。他们在训练后将充当主要的士官。新军军官初期以穿越者为主，逐步补充军校学员，因此应尽快建立义军军校。军校初期学员以本地童生、有文化的士兵为主。早期军校可以考虑和行政官员学校、技师学校合编办学。如果没有这个条件，也可以考虑采用教导队的形式进行军官养成。
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