麦华陀趁机调遣军舰开赴南京，威胁两江总督曾国藩。清廷与之交涉数月未果，遂令蒲安臣使团借访问英国之机直接与英国政府交涉。
依赖蒲安臣等人对西方外交游戏规则的熟悉，交涉得以成功，双方协定：此后发生同类事件的处理办法必须循约而行，“不得擅调兵船与地方官争执”，并迫使英国外交部发表官方声明，公开承认麦华陀的擅自调兵威胁中国地方官员行为欠妥。表示尊重中国的主权和司法权。但英国仍然表示对使用武力“以便保护生命财产受到迫切的危害”持保留态度。
这份声明发表后不久，又发生了英国驻中国台湾淡水领事吉必勋擅调兵船。向台湾地方官勒索白银的事件。清廷依据协定，照会英国政府。英国政府遂下令吉必勋向中国缴回所勒索的银两，并向淡水中方官员赔礼道歉，随后并将吉必勋革职。
“我有理由表示怀疑，威妥玛先生擅自调动舰队而没有受到质疑和惩罚，是得到了迪斯累利先生的授权！”格莱斯顿向前探着身子，逼视着对面的保守党议员们，大声说道。“一位驻外公使，竟然能够拥有调动整个远东地区的舰队的权力！难道他是古罗马的恺撒？迪斯累利先生的政府对这件事，为什么没有向国会说明？如果迪斯累利先生的政府不知道这件事