江、齐齐哈尔、墨尔根、吉林、旅顺口、天津、京口、乍浦、广州、福州等地设立了10个八旗水师营，人数不足万人。绿营水师则是清代旧式水师的主力，承担着海防的主要任务。凡有水师的省份都设有水师提督或水陆提督，统辖全省水师。基本建制为营，分为本标营（直辖）和分防营（分驻各地）两种。每营由参将、游击、都司、守备充任统将，水师营下又分哨、司两级。哨由千总统领，司由把总统领，人数多少不等。外海水师设于直隶、山东、福建等省，内河水师设于湖南、湖北、安徽、江西、广西等省，而江苏、浙江、广东三省则外海、内河水师兼备，全国绿营水师的总额估计在15万到20万人之间。
清代旧式水师装备落后，战船名目繁多，均为木制，容易朽蚀。动力主要靠人力划桨摇橹，辅以桅帆，甲板上不设防卫设备，因而防护性能极差。水师的武器分火器和冷兵器两大类，船炮多为泥模铁铸。前膛装弹，炮管无膛线，威力不大。火枪为火绳枪，射程近，杀伤力小，冷兵器则是刀、矛、弓箭等传统武器。由于驻防分散，军制落后。装备陈旧，缺乏训练，积重难返，绿营水师日趋**和废弛。因此。当太平军兴起时，绿营水师根本无力与之抗衡。太平天国战争结束后，各省水师多已不堪使