崇祯十一年二月，南原之战爆发，马科与曹变蛟击败李自成，穷追将其逼入潼关，不少人都说，在此战当中马科之勇亦不输后者。
马科在崇祯十五年之前，都是屡立战功，声名赫赫，但自那年追随洪承畴参与松锦之战溃归之后，失败的阴影便一直笼罩在他头上。
起先阁臣议定是要治马科的罪，后来发现王朴这货还不如马科，后者起码功勋不少，都是力战而败，前者是想跑都没跑了，带动大军连环崩溃。
就算松锦战败逃过一劫，马科的人生也没有迎来曙光，接踵而至的却是无尽的黑暗，在崇祯十五年之后，马科转战各地，但几乎都是一连串的战败和丢盔弃甲。
他先是率部迎击入寇清军，被阿济格击败，再是立下军令状，率部北进遭遇济尔哈朗率领的清军，又败，而且这次是一触即溃。
历史上的崇祯皇帝念其勇猛，没有采纳兵部定罪削职之议，让他跟着李建泰出征剿闯。
李建泰这个人都知道，崇祯皇帝御驾亲征也是遇见过这厮的，马科跟着他以后便销声匿影，再无大功。
究其原因，自是李建泰逢战避敌，自相残杀，马科无用武之地，只能跟着李建泰到处漂泊。
后来李建泰被弹劾，崇祯皇帝将