圣城巴比伦被称为世界上最伟大的城市，也被称为神的著作，它位于整个大陆的正中心。所有流传世界的文字律法全部出自于这里，是集信仰，政治，文化以及商业的发源地，人类文明的开端。圣城分为下城和内城，下城并不是字面意义上的下面的城市，而是环绕内城而扩建的新城，据说历史要比内城短上千年。神圣帝国传播正统宗教，集合大陆权利，俗世政权的一切事物都在下城处理，造就了天下第一城的繁华。
与下城的熙熙攘攘有着天壤之别，内城处于圣城中心却是安静的，平时禁止主教职位以下的所有人进入，包括曾经万国来朝的王室贵族们，也不得擅自进入。每年内城会在神祝日开放三天，以及教皇交替之时会额外开放两天，供所有人朝拜。圣学游记中这样写道“没有进入过圣城的人生是不完整的，而进入过主圣城的人生是幸福的。”全圣城任何角度都能看见那高耸入云的神殿，据说那是神明建立并且居住过的地方，柱子有百人叠起之高，又有二十人环抱之粗，全殿1096根柱子支撑，绝非人力所为。
居住在下圣城的人都称呼内城为主圣城，乃是神明仙时去留下的，每天敬拜圣城可以得到神明的庇佑，朝夕两拜也是此地独有的风俗文化。据说曾有圣阶强者进主圣