所以当夜刺客杀人的时候他们不闻不问，但到了第二天早晨，六科给事中却一齐弹劾东厂、锦衣卫懈怠渎职，办事不利，有刺客潜入京城杀人，居然事先未能察觉，事后又未能抓捕，可谓无能之极，如此辜负朝廷社稷，罪当不赦！
六部九卿更联名上奏，直指阉逆祸国殃民，败坏朝政，擅杀功臣大将，致使京师城防形同虚设，更怯懦畏死，纵容刺客行凶，应当立刻将东厂、西厂、锦衣卫的首脑凌迟处死！
这一番弹劾，半真半假，有些事是实情，有些事却纯属诬告，但词锋犀利，咄咄逼人，更先下手为强，将不少太监、锦衣卫下了大狱，严刑拷打，逼问同谋，大有把宦官派系一网打尽之势！
那些手握重权的老太监历尽宦海沉浮，也绝不是省油的灯，这些文臣借题发挥，乃是他们意料中之事，所以立刻开始了反击，东厂、锦衣卫倾巢而出，四处抓捕朝廷命官，诬指刺客是他们派来的，意欲颠覆大明王朝，这是株连九族的大罪，显而易见，宦官派系不仅要把政敌往死里整，更要斩草除根！
大明京城锄奸一役前后，所有的事情似乎都在反常，武将舍生忘死，为国为民，却遭到陷害，叶青冥与此事无关，却甘冒奇险复仇，奸党明知刺客杀人，却消极怠战，事后又相互指