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奉天武备学堂一共分为高中低三个班次，每个班次都分为炮兵、工程、步兵、骑兵、辎重、宪兵，五个大的科目，同时还可办了特种兵科，共有军事教员二百人，承担所有教学内容
，同时还雇佣了一些工程师，为学员教授数学、地理、物理等课程。
武备学堂设置校长一人，石达开；教务长建总教官一人，徐怀瑾；下面分成三个高中低三个级别军事班；同时为了规范管理，学校成立军法科、军务科、行政科、后勤科等十余个科室，为了监督军纪，张毅直接成立了军纪纠察大队，严格考察军容风纪。
同时，张毅直接将三大纪律八项注意里面的内容精髓提炼出来，加以修改完全，制定了奉天武备学堂军人纪律规范，规定每天必须诵读一边，严格遵守。
至于军事课程与军事条例，张毅完全委托给了德**事教官制定，这些军事教官还真不是盖的，除了将德**事训练大纲与课程带过来以外，更是与张毅、徐怀瑾一起研究，推出了世界经典战例分析，将古今中外的经典战例完全利用起来，加以全方位的复原、推演、分析，并且反思得失，这个创意乃是克里夫那个家伙提出来的，得到了张毅的大力支持，直接赏赐了克里夫千两