由于宇智波家族在木叶受到团藏的压制，又将宇智波止水杀害，使得族人不愤即将叛变。鼬面见木叶高层汇报了这一情况！
在场的高层中只有三代目火影坚持想以谈判的方式解决宇智波政变，但因为事情已经来不及改变最后只说请鼬帮他争取一点时间，事实上除了歼灭宇智波全族之外已再无其他善法。
团藏之后找到了宇智波鼬，以鼬的弟弟宇智波佐助的性命作为交换让宇智波鼬诛灭全族并对佐助保密，自己以叛忍的身份搜集对木叶不利的组织情报。
为了保护村子防止其他国家乘虚而入，也是为了止水的意愿和弟弟的性命。鼬在痛苦与煎熬中被迫接受了灭族任务。
鼬与带土一起动手诛灭了全族，并给佐助设定了一个向自己复仇这一目标之后逃离木叶，临走前威胁团藏如果敢伤害佐助就将村子情报出卖敌国。逃离之后根据带土的建议加入组织-晓。
而猿飞日斩默许了这个事实并答应鼬保护他的弟弟。
鼬很快就恢复过来，眼睛由红转黑，对林晨说：“真是几年不见，越加厉害了呢！”
“如果你全力出手，或许我只有八门遁甲才能比得过你。”林晨很自信的说道，双方都是有精英影级的实力，