说的都对。朕现在病了很长时间，怎能临朝听政。”又说：“朕确实不自谨，导致现在身体多病。如果朕能够在偏殿议政，岂能遭受这个人的责备辱骂呢？”遂逮捕海瑞关进诏狱，追究主使的人。狱词送上后，仍然留在宫不发布。户部有个司务叫何以尚的，揣摩皇帝没有杀死海瑞的心意，上书陈请将海瑞释放。皇帝大怒，命锦衣卫杖责一百，关进诏狱，昼夜用刑审问。过了两个月，嘉靖皇帝死，明穆宗继位，海瑞和何以尚都被释放出狱。
出狱
嘉靖皇帝驾崩，尚未发丧。提牢主事听说了这个情况，认为海瑞不仅会释放而且会被任用，就办了酒菜来款待海瑞。海瑞自己怀疑应当是被押赴西市斩首，恣情吃喝，不管别的。主事因此附在他耳边悄悄说：“皇帝已经死了，先生现在即将出狱受重用了。”海瑞说：“确实吗？”随即悲痛大哭，马上吐出吃着的食物，在吐的时候。旁边和他吃饭的狱卒都搞不懂怎么回事儿，吓的赶紧躲到旁边。之后被释放出狱，官复原职，不久改任兵部。提拔为尚宝丞，调任大理寺。
倍受排挤
万历初年，张居正主持国政，由于海瑞的过分正直，虽然敬仰海瑞，海瑞严峻刚直，外官员多次推荐，最终也不任用。有一次张居正的儿在