教和基督教的教堂在九州各地如雨后春笋地冒了出来。
九州的基督势力原来就有了一定基础，现在此消彼长之下已经由抗衡逐渐发展到了压制传统佛门的地步。不过夹在他们之中的地方神社出于传统的恩怨，这次也站到了基督教的一边，佛门为了不被挤出九州剧烈地抗争了起来。
在东北地方这类问题同样存在，因为我为了履行当初的承诺给了北海道的哥萨克更大的生存空间，蛎崎家迁往奥州补偿的领地上，北海道只在函馆留下了一个象征性的管理机构。
同时在战争中立功的哥萨克得到了部分土地，分别散落在东北、北陆、甲信、纪伊等地，哥萨克经营北海道土特产的商铺在北方各大镇町也逐渐出现，自然而然东正教的传播也出现了。
这些地区都是地方神社的地盘，除了本愿寺一向宗当初时不常的搞几次一揆之外，其他佛门宗派全都影响甚微，就连上杉谦信都是信奉毘沙门天王的神道信徒。
因为双方的信众差异很大，利益冲突不是那么尖锐，最主要的是东正教的侵略性不像天主教那么强，所以还没有把矛盾演变成公开的敌对，不过钝刀割肉往往更让人难受。
京都和近畿地区还是传统佛门势力的天下，但是随着天下