立军事武力就能挽救的。非得彻底地改革政治，推翻清廷这个腐败的政权才行。
他于是与傅慈祥、沈翔云等人，发起组织了第一个留日学生团体“励志会”。该会以“联络感情，策励志节”为宗旨。目的是联络同志，讨论革命如何进行。
他此时的革命思想，还是处于一种自发的状态。
此时侨居日本横滨的孙中山先生，在日成立兴中会，并注意从留学生中吸收成员。
吴禄贞经人介绍认识了孙中山先生，他对孙先生学识之丰富，非常佩服;对孙思想见解之成熟，也十分倾心。
交往之中，对孙先生的革命理论，有了深入的认识，毅然加入了兴中会。从此，他成了一名民主革命的自觉的战士。
这就是孙中山先生在祭文中所说的：“昔在东海，谈笑相逢。”
他们的革命友谊，从此开始。
一九九零年夏，中国北方义和团反帝斗争进入了**，革命党人决定趁此大好时机，在南方发动起义。吴禄贞认为“夏口兵冲要地”，建议以武汉为发难基地，以便控制南北要冲，然后出师北伐。
孙中山先生赞同此建议，命吴禄贞、傅慈祥主持长江流域的起义，又派人回国联络会党;他自己则将主持珠江方面的起义。