会迅速发展，医院骑士团医疗事业也受到了基督徒们广泛赞誉。从1110年起修会同意将分散耶路撒冷的领土的财产，可以交给医院骑士团。
1113年，教廷承认他们是独立的修会；并赐予他们一系列的经济、政治特权，如无需缴纳十一税，无需接受任何政权的领导，只受教皇节制。
医院骑士团成立初期，只是一個行善的组织。直到1120年，医院骑士团才开始作为一个军事修会进行活动，以武力保护朝圣者免受异教徒攻击，并发展成为耶路撒冷王国的一支重要军事力量，对耶路撒冷的政局也有很大的影响力。鲍德温三世称赞他们“医术精湛、装备精良、信仰虔诚”。
医院骑士团的会规以奥思定会的会规为基础制定。骑士团的成员分为教士、骑士和士官，以及会友或受赠者。骑士团由一位大团长统治，并有教士会议和八位法官协助。其组织和圣殿骑士团十分相似，但对于慈善事业上表现更为显著。
不同于圣殿骑士团中间被解散转入地下发展，医院骑士团从创立之处到如今，可是一直存在。因此保留了非常好的传承，延续上千年，着实不容易。
当年丢失圣杯，医院骑士团也有一定责任；现在必须要拿出诚意，至少要让信徒看